이 시대는 그 어느 때보다 복음에 기초한 기독교의 선교운동을 절실하게 요구하고 있다. 주안대학원대학교는 다양한 분야의 전문능력을 갖춘 맞춤 교육을 시행함으로서 민족 복음화와 세계 선교를 위한 전문 선교지도자 양성을 목표로 한다. 그리스도의 사랑과 섬김의 봉사정신으로 복음 사역에 필수적인 인재 육성에 힘을 다하여 인류사회의 발전과 복지, 평화를 구현하는 선교적 사명을 완수하고자 한다. 이에 주안대학원대학교 헌장을 제정 공포하여 교육 및 연구기관으로서 국가와 인류사회에 대한 책무를 다할 것을 선언한다.
이 헌장은 학교법인 이사정수의 2/3이상 찬성에 의한 이사회의 의결을 거쳐 누가 기록하는 방법에 의하여 보완할 수 있고 이를 관할청에 제출한다.
이 헌장은 2004년 7월 28일 공포한다.
이 헌장은 2010년 2월 25일 전면개정 공포한다.